More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0199 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  61.9 
 
 		 261 aa  342  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  60.71 
 
 		 254 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  56.35 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  55.38 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  53.97 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  53.12 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  52.96 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  51.21 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  50.81 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  50.81 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  50.81 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  51.59 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  51.21 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  51.43 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  51.43 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  51.43 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  51.43 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  51.43 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  52.23 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  51.43 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  52.05 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  51.02 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  51.07 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  49.22 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  47.79 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  47.79 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  47.79 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  50.2 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  50.2 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  50.2 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  47.81 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  46.18 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  48.61 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  48.61 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  51.08 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  48.22 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  46.61 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  44.88 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  44.27 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  42.35 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  49.15 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  42.23 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  38.71 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  42.46 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  44.31 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  47.56 
 
 		 230 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  41.49 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  37.85 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  36.36 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  37.05 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  41.13 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  37.3 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  35.32 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  34.92 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.19 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  34.23 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  36.55 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  35.22 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.41 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.92 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.31 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  35.22 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  35.22 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  32.1 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  32.1 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.08 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  29.58 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  29.88 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  29.88 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  29.05 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  28.23 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.26 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.42 
 
 		 558 aa  95.5  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.17 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  28.86 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  27.67 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  29.17 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  27.64 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  27.35 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 437 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  26.34 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>