More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4536 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 
284 aa  293  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  50.39 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  50.39 
 
 
262 aa  271  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  56.84 
 
 
273 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  54.98 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  51.3 
 
 
284 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
284 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
284 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.06 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
287 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
276 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
268 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
259 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.7 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
263 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 
326 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
323 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
273 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
265 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  35.91 
 
 
258 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
285 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
425 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  34.25 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
279 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.87 
 
 
286 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
282 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
280 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  30 
 
 
294 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
310 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.55 
 
 
233 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.94 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.67 
 
 
296 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
255 aa  92  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
270 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.98 
 
 
296 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.33 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.62 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
220 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  27.23 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  37.67 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  28.12 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.76 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  26.5 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  26.07 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.51 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.35 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.64 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.61 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.7 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.78 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>