More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1674 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  62.05 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  55.44 
 
 		 298 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  48.44 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 		 304 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  45.94 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  48.98 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  48.42 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 		 288 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  46.45 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  43.79 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  48.43 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  44.22 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  44.11 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  43.26 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  41.46 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  42.42 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  44.24 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  41.28 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  41.01 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  40.93 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  41.88 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  39.65 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  41.09 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  40.14 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  34.06 
 
 		 345 aa  162  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  32.73 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  32.89 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  33.45 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  33.81 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  32.74 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  32.86 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  31.13 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  32.37 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  32.62 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  27.84 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  27.64 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.2 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.75 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  29.59 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.281288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>