More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1534 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  36.49 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  31.97 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  31.7 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 331 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  33.85 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 343 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 		 378 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  28.72 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  29.08 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  32.21 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.89 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.89 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 		 356 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  27.62 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  27.15 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  28.67 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  27.5 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  28.21 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  28.73 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 355 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  29.83 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0602  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  29.73 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  33.59 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  34.67 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  34.17 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>