More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0034 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  71.86 
 
 
298 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  63.01 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  62.33 
 
 
319 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  57.89 
 
 
298 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  51.38 
 
 
302 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  49.16 
 
 
356 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  48.33 
 
 
302 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
298 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  47.3 
 
 
304 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  46.32 
 
 
301 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
301 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  43.58 
 
 
313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  43.48 
 
 
306 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  44.75 
 
 
300 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  45.92 
 
 
286 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 
288 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  41.49 
 
 
307 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
297 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
302 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
296 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
299 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  42.32 
 
 
292 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
312 aa  188  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 
355 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 
300 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  43.8 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
314 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
302 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  40.42 
 
 
300 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
300 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
284 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
330 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
334 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  41.22 
 
 
306 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  35.96 
 
 
330 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
343 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  34.9 
 
 
328 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
329 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  34.34 
 
 
328 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  43.08 
 
 
308 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
331 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
378 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  40.77 
 
 
301 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 
285 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  38.69 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
290 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  37.89 
 
 
291 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
331 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
311 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
331 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  30.1 
 
 
345 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
296 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
345 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.88 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
285 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
319 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  32.09 
 
 
287 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
279 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  32.21 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  32.21 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  32.21 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  31.85 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  31.88 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  32.21 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  32.55 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  30.42 
 
 
336 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
284 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  30.42 
 
 
359 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  33.7 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
304 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
321 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 
281 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
274 aa  99.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32 
 
 
294 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.34 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>