More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3711 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  74.92 
 
 
302 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  66.78 
 
 
307 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  54.88 
 
 
299 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  51.39 
 
 
301 aa  270  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  48.42 
 
 
302 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  48.57 
 
 
298 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
329 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  43.79 
 
 
301 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 
343 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
356 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  43.38 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  43.38 
 
 
328 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  43.75 
 
 
330 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  44.85 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  46.21 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  44.49 
 
 
378 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 
319 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  44 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
298 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  43.11 
 
 
309 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 
331 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
331 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 
312 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 
300 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  42.29 
 
 
297 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 
300 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  42.72 
 
 
306 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  45.68 
 
 
304 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  43.68 
 
 
288 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  40.73 
 
 
300 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 
319 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 
302 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  42.14 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 
301 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 
301 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
302 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  41.86 
 
 
292 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 
355 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
345 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 
300 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
345 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  40.36 
 
 
318 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  41.79 
 
 
305 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
334 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
319 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  40 
 
 
301 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
318 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  40.31 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
284 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
285 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  33.57 
 
 
287 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  33.57 
 
 
287 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  33.21 
 
 
287 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  32.86 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
311 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  32.5 
 
 
287 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  32.86 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  32.86 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 
281 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  34.3 
 
 
294 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  32.86 
 
 
284 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
279 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 
290 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
308 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
280 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  34.39 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 
282 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
321 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
307 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
304 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 
291 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.21 
 
 
336 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.21 
 
 
359 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
274 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0602  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.47 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>