More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4056 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
319 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  69.81 
 
 
309 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  64.26 
 
 
298 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  62.33 
 
 
302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  56.54 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 
302 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  47.95 
 
 
356 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  46.92 
 
 
298 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  49.12 
 
 
301 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  48.95 
 
 
304 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  45.57 
 
 
306 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  43.55 
 
 
299 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 
286 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
313 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 
297 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  41.32 
 
 
296 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 
288 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  42.66 
 
 
314 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
302 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
312 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  43.94 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
297 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 
284 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  40.21 
 
 
307 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  42.81 
 
 
292 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
302 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
334 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 
285 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
300 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  43.25 
 
 
305 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  40.77 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  40.15 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  37.68 
 
 
330 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
319 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  38.43 
 
 
306 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  34.9 
 
 
287 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  33.9 
 
 
287 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  34.9 
 
 
287 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  34.56 
 
 
356 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  33.56 
 
 
287 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  34.23 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  32.54 
 
 
284 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  37.41 
 
 
378 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
285 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 
345 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  33.56 
 
 
287 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.77 
 
 
284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  37.54 
 
 
328 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 
308 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  37.54 
 
 
328 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
296 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
280 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  39.8 
 
 
301 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
331 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
281 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  35.23 
 
 
294 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  37.87 
 
 
288 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
319 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.64 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.58 
 
 
359 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  36.12 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
321 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
281 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
304 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
304 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 
274 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
284 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  35 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.64 
 
 
259 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.71 
 
 
279 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>