More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1656 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  68.32 
 
 		 306 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  49.33 
 
 		 302 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  48.79 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  48.45 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  46.85 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  47.95 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  44.48 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  43.21 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  43.34 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  45.92 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  43.92 
 
 		 355 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  43.6 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 300 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  44.44 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  41.05 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  40.89 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 329 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  45.68 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  42.41 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 		 378 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  37.5 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  39.37 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  38.51 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  41.37 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  37.59 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  40.3 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  37.58 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  39.65 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  35.23 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  34.11 
 
 		 356 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  34.78 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  34.45 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  34.45 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  34.11 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  33.78 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  33.78 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  33.1 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  33.33 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  33.11 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  35.17 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.5 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.9 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0602  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 250 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>