More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3170 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  56.61 
 
 
298 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 
309 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  57 
 
 
319 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  56.95 
 
 
302 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
302 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 
302 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 
298 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 
301 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
301 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  46.13 
 
 
286 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  42.71 
 
 
288 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  42.12 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  43.05 
 
 
313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  44.95 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
300 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
296 aa  211  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  44.36 
 
 
300 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
301 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
301 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
302 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  43.11 
 
 
307 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  44.85 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 
302 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  42.56 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 
310 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  40.91 
 
 
292 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  41.4 
 
 
301 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
343 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
329 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 
284 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  38.89 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
330 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
331 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
378 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  40.68 
 
 
330 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  38.89 
 
 
328 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
300 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  37.73 
 
 
318 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  40.29 
 
 
291 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.01 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
345 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
331 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
331 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
285 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
285 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
290 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 
311 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  31.76 
 
 
284 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  33.11 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  32.66 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  31.76 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  32.77 
 
 
287 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  37.46 
 
 
306 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 
308 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  31.76 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
280 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.72 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  31.94 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 
282 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  35.28 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  33 
 
 
294 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
291 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 
321 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
288 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
304 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
284 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
274 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.99 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
266 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>