More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2896 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 
321 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  34.3 
 
 
359 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  34.3 
 
 
336 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  33.08 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  34.57 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  33.46 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  34.57 
 
 
287 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  34.2 
 
 
287 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
281 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  32.33 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  32.71 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  32.71 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1045  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
304 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 
300 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  36.65 
 
 
306 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
280 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
288 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  29.9 
 
 
345 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
291 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
331 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  37.16 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
343 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 
286 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
304 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
319 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  31.49 
 
 
306 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  31.31 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  29.1 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  29.1 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  33.33 
 
 
292 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
301 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
331 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
309 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
331 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
290 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
298 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
302 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 
307 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
319 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
297 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
285 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
334 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
312 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
302 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
284 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
301 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
281 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10659  lipase/esterase lipG  31.25 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0519143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  30.69 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  27.84 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.3 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.65 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.37 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.99 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.99 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>