More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1042 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  38.72 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  34.4 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  34.24 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.33 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.41 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.09 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  33.33 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 284 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.18 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.71 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.64 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  35.08 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  32.16 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  31.72 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  31.72 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  31.72 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  36.15 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  32.16 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  31.72 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  31.77 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.62 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  31.72 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  34.09 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.56 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.78 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  31.8 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.12 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.34 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.65 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.43 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  31.5 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 275 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.98 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.77 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  31.87 
 
 		 387 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.61 
 
 		 425 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  34.44 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.76 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  31.92 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 387 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>