More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1154 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  86.05 
 
 		 259 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  53.75 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  54.13 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  52.16 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  49.41 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  50.83 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  47.48 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  46.64 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  46.64 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  46.64 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  46.22 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  46.22 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  46.22 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  44.76 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.27 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  32.94 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.41 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.54 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  34.54 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.74 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.96 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.53 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.26 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.91 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  33.73 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 392 aa  88.6  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 397 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.5 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.22 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 		 396 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  26.4 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  28.44 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.85 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.55 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.51 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.73 
 
 		 425 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>