More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  96 
 
 
275 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  63.74 
 
 
265 aa  341  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  62.64 
 
 
267 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  59 
 
 
262 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
270 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 
270 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 
270 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  56.41 
 
 
270 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.65 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.46 
 
 
425 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
273 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
263 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  34.41 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 
256 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.47 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
256 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
265 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
276 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
259 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
278 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
260 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
260 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
263 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
268 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.52 
 
 
265 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 
251 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
265 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
286 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
267 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
266 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
260 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
270 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
259 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 
260 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
262 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 
282 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.3 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  28.93 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.35 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 
260 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.21 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
266 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
259 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 
264 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  31.33 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.81 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  46.88 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
270 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>