More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1820 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
267 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  46.46 
 
 
278 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  49.41 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  48.56 
 
 
270 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  47.45 
 
 
259 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  49.38 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  48.31 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  48.31 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  48.31 
 
 
270 aa  231  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  47.88 
 
 
266 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  47.88 
 
 
266 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  47.88 
 
 
266 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  47.46 
 
 
266 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  49.38 
 
 
260 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  49.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 
268 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
266 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  46.25 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
265 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 
265 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
267 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.49 
 
 
425 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
270 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 
270 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
266 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.63 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.95 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.91 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.56 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.79 
 
 
262 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.78 
 
 
275 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
276 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  27.69 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.74 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
392 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.2 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.1 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.89 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.4 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  24.61 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  29.55 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.69 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.58 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  28.17 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.85 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.85 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>