More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3438 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  83.33 
 
 
282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  79.43 
 
 
282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  83.03 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 
277 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  74.01 
 
 
292 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  74.01 
 
 
277 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  41.26 
 
 
294 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 
275 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
275 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  34.25 
 
 
278 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
281 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.64 
 
 
425 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  34.15 
 
 
249 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 
256 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  31.28 
 
 
380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 
282 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
281 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 
373 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.99 
 
 
279 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
279 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.82 
 
 
259 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  31.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 
263 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
265 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.71 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  33.05 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
262 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
265 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  32.94 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  34.4 
 
 
266 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
261 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  32.94 
 
 
264 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.76 
 
 
265 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.66 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
264 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 
261 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
253 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.74 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
265 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
265 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
260 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
393 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 
266 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
265 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
256 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.59 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
263 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
271 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 
260 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  30.96 
 
 
270 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
263 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>