More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1310 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 269 aa  543  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  73.38 
 
 		 280 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  48.06 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  46.12 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  46.51 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  47.89 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  46.51 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  46.51 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  46.51 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  46.51 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  46.33 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  46.33 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  45.35 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  52.87 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  47.29 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  48.08 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  40.31 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  37.35 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  37.94 
 
 		 274 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  38.21 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  34.69 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  45.71 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  34.65 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  36.4 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.67 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  33.72 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.67 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.44 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.25 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.83 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  32.92 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.95 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.73 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.47 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.93 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.42 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.64 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.77 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.62 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.02 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.34 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.91 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.77 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  32.34 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  32.34 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.91 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.56 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.54 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.51 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.66 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.91 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>