More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3282 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.49 
 
 		 272 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.07 
 
 		 272 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.07 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  56.43 
 
 		 274 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  57.26 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  55.83 
 
 		 256 aa  272  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  53.28 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.61 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.31 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.9 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.9 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.31 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.9 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  45.49 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  45.49 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  45.49 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.08 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.69 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.69 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.28 
 
 		 252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.28 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.87 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.38 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  42.86 
 
 		 275 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.7 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.93 
 
 		 263 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.65 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  39.91 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  30.47 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  34.63 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.53 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.3 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.72 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.8 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.8 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.91 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.2 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.56 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.68 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  24.31 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  29.96 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  32.6 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>