More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1879 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
270 aa  563  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  55.79 
 
 
268 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 
277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  49.62 
 
 
265 aa  258  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  48.5 
 
 
301 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  49.03 
 
 
267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 
262 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
283 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  35.36 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
267 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  38.34 
 
 
267 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
285 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
269 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 
271 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
278 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.54 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
250 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  34.66 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
270 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
270 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  30.12 
 
 
270 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
277 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.23 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.34 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  29.5 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  31.84 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  30.52 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 
270 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 
270 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
267 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
267 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.51 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
264 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  33.48 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.16 
 
 
252 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.64 
 
 
258 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.34 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.67 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  31.46 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.71 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.35 
 
 
255 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.67 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
267 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  32.72 
 
 
275 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.96 
 
 
252 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
256 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.96 
 
 
252 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
265 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.96 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
265 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.15 
 
 
264 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.41 
 
 
252 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.15 
 
 
272 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.54 
 
 
252 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.15 
 
 
272 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  30.13 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  30.13 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.13 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.52 
 
 
264 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
270 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.74 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.06 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  30.38 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.19 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.77 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
267 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.03 
 
 
274 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.6 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.34 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  27.31 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>