More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3600 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  54.79 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  50.39 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 267 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  49.22 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  49.8 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  46.12 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  47.29 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  44.78 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  46.9 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.81 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.84 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.16 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.77 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.15 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.06 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.46 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  38.89 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.74 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.74 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.74 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.74 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.89 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.49 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.49 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.1 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.49 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  39.67 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.39 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.49 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.55 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  31.92 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.15 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.15 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.14 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.25 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  31.52 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  32.1 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  30.86 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  31.28 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.86 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  30.86 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.86 
 
 		 270 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.41 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  26.28 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  51.09 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  31.34 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.95 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  31.34 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  30.36 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.58 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  33.77 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>