More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3768 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  97.75 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  95.88 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  82.2 
 
 		 266 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  68.7 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  68.7 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  67.69 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  67.56 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  66.79 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  52.34 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  46.61 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  49.22 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.93 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.52 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.76 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.6 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.38 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.19 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.1 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.38 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  35.8 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.98 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.98 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.51 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.98 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.74 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.2 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.33 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.34 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.81 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.34 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.81 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  30.31 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  32.42 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.42 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  32.42 
 
 		 274 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.03 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.34 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.64 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  30.92 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.93 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  32.35 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  31.09 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  31.09 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.25 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  29.83 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  29.83 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.83 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.25 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  29.48 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.35 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.6 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.64 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.42 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.42 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.61 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  29.19 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.61 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.74 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>