More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3202 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  87.55 
 
 
274 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  62.89 
 
 
263 aa  324  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  62.4 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.53 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.53 
 
 
272 aa  301  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  59.14 
 
 
272 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  57.26 
 
 
255 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.17 
 
 
252 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.17 
 
 
252 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.17 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.75 
 
 
252 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.74 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.32 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  48.32 
 
 
252 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  48.32 
 
 
252 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  48.32 
 
 
252 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.52 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.34 
 
 
258 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.32 
 
 
252 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.1 
 
 
252 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.47 
 
 
252 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  44.81 
 
 
275 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.37 
 
 
263 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.8 
 
 
264 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.53 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.22 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 
265 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
260 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
261 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  41.92 
 
 
256 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  35.86 
 
 
266 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
267 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
264 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 
264 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
267 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
264 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 
270 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
262 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
267 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  27.67 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
270 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 
270 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  30.52 
 
 
265 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
277 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.21 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.21 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
269 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
267 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.03 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  29.03 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  28.23 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 
270 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
267 aa  92  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 
250 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.03 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  30.86 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.38 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  22.98 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  28.99 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  42.35 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.04 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  39.62 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  27.78 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.74 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  27.93 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>