More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2432 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  59.7 
 
 
265 aa  331  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  57.8 
 
 
301 aa  323  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  60.77 
 
 
267 aa  318  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  55.19 
 
 
262 aa  275  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  54.66 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  42.13 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 
267 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 
283 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  42.35 
 
 
274 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
285 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  37.94 
 
 
270 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 
280 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  36.8 
 
 
270 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  37.2 
 
 
270 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  37.2 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  36.8 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  36.8 
 
 
270 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  36 
 
 
270 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  36.4 
 
 
270 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  36.4 
 
 
270 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
250 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
270 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
278 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  35.1 
 
 
266 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  37.2 
 
 
270 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 
277 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
270 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  32.31 
 
 
267 aa  135  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
264 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
264 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 
264 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
267 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
260 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
256 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  31.5 
 
 
266 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.42 
 
 
258 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
267 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  31.99 
 
 
275 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
267 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.68 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  31.38 
 
 
252 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
252 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.38 
 
 
252 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  31.38 
 
 
252 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.64 
 
 
264 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.96 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.71 
 
 
263 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.38 
 
 
252 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.4 
 
 
252 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.4 
 
 
252 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.38 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.09 
 
 
252 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.47 
 
 
263 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30 
 
 
252 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
265 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30 
 
 
252 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.16 
 
 
255 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.54 
 
 
252 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.36 
 
 
272 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.33 
 
 
256 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.36 
 
 
272 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.96 
 
 
252 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  32.56 
 
 
271 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28 
 
 
272 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
265 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.86 
 
 
264 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.28 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1626  thioesterase, menaquinone synthesis protein  31.62 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.833654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.63 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  27.38 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
281 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.14 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  27.27 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  37.4 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>