More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3013 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  100 
 
 
263 aa  533  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  65.23 
 
 
256 aa  345  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  62.89 
 
 
266 aa  324  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  62.7 
 
 
274 aa  321  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  58.26 
 
 
272 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  56.42 
 
 
272 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  56.42 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  53.28 
 
 
255 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
252 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
252 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  50.21 
 
 
252 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  50.21 
 
 
252 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  50.21 
 
 
252 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.45 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  50.21 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.79 
 
 
252 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  49.79 
 
 
252 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
252 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
252 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  51.04 
 
 
252 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  50.62 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  50.41 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  50.21 
 
 
252 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  47.77 
 
 
275 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.56 
 
 
263 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  48.35 
 
 
264 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.6 
 
 
264 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.32 
 
 
252 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 
259 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
260 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
264 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  37.01 
 
 
266 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  39.68 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
264 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
264 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 
270 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 
265 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
267 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
267 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
285 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 
278 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  28.85 
 
 
274 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  32.68 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
269 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
267 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  30.47 
 
 
270 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  30.47 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.08 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  30.08 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
267 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
277 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
277 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
283 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
262 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
270 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
270 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
267 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
271 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  29.3 
 
 
270 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
280 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
267 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  32.39 
 
 
266 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.73 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  29.25 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.86 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.77 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  30.8 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  27.27 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  28.36 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  37.78 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  22.68 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  22.68 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
293 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>