More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1128 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.04 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45.04 
 
 
252 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  45 
 
 
252 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.17 
 
 
252 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.17 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  46.06 
 
 
258 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.35 
 
 
252 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.35 
 
 
252 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  43.93 
 
 
252 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  43.93 
 
 
252 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  43.93 
 
 
252 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  44.35 
 
 
252 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  42.59 
 
 
277 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.51 
 
 
252 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  43.51 
 
 
252 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  39.43 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
264 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.69 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
260 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  39.11 
 
 
267 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
264 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 
267 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
262 aa  158  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  42.68 
 
 
252 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
267 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  37.7 
 
 
252 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.71 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  42.17 
 
 
256 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
265 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  40.96 
 
 
266 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  35.89 
 
 
266 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.33 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  35.66 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.26 
 
 
255 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
259 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  41.15 
 
 
274 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
265 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.56 
 
 
264 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  34.29 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
267 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.09 
 
 
272 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.68 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  38.68 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
262 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
277 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  31.75 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  39.67 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  28.94 
 
 
274 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.35 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
268 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  38.27 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
277 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
270 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.98 
 
 
270 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 
270 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
277 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
270 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
271 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 
266 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 
270 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.19 
 
 
270 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.19 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
267 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
267 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.98 
 
 
270 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14030  hypothetical protein  36.41 
 
 
337 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  29.3 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1626  thioesterase, menaquinone synthesis protein  33.6 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.833654  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.5 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  31.13 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>