More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2894 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  45.9 
 
 
283 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
277 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  38.96 
 
 
274 aa  192  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 
280 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
269 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  38.96 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  43.95 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
267 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  40.24 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 
270 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
277 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  39.11 
 
 
265 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
270 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  44.71 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  38.15 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  38.15 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  37.75 
 
 
270 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  37.75 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 
270 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  37.35 
 
 
270 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  37.35 
 
 
270 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  44.58 
 
 
270 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  37.75 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  38.7 
 
 
301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 
268 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
270 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  37.75 
 
 
270 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  36.51 
 
 
266 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
261 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  44.72 
 
 
244 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 
256 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
259 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
262 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
267 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  32.28 
 
 
266 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  34.26 
 
 
264 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
267 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 
264 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
264 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 
271 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  36.47 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2813  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.6 
 
 
258 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.34 
 
 
255 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
265 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.08 
 
 
264 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.25 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.57 
 
 
263 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.46 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  35.22 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.41 
 
 
252 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2652  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.41 
 
 
252 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.41 
 
 
252 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2559  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.33 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.41 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.01 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2409  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.33 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0325408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3405  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.33 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0367358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02190  predicted peptidase  30.9 
 
 
252 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1394  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
252 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02149  hypothetical protein  30.9 
 
 
252 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
307 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2418  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.9 
 
 
252 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.081901  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2642  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.33 
 
 
252 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0298629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1385  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  30.47 
 
 
252 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.47 
 
 
272 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
270 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.47 
 
 
272 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  33.47 
 
 
272 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5610  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
269 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  29.3 
 
 
275 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3202  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  31.98 
 
 
266 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1112  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  32.65 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
280 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.74 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01430  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.57 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  30.61 
 
 
234 aa  86.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.14 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.21 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.42 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>