More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2964 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
299 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
299 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  32.36 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  30.55 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  28.68 
 
 
253 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  29.26 
 
 
257 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
256 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
252 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  29.17 
 
 
255 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  27.88 
 
 
259 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
264 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
261 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30.6 
 
 
265 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  29.3 
 
 
259 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
257 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  28.62 
 
 
258 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
271 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
267 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
254 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  28.52 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  28.2 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  29.1 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
252 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  30.11 
 
 
295 aa  92  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
270 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
264 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  28.95 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  28.19 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.52 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  26.91 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  25.56 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.52 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.86 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.37 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.65 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.11 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
309 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
288 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
255 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
269 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.37 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.56 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.34 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.1 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  28.87 
 
 
230 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.56 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>