More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5337 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  43.95 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 264 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  42.17 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  40.73 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  40.59 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  39.27 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  36.19 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  35.16 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.93 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  37.69 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  35.92 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.29 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  34.82 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  32.8 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  32.3 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  31.52 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  32.81 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  34.77 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  35.12 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  33.33 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  35.12 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  34.01 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  33.6 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.56 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  33.2 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  31.09 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  34.14 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  34.14 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  34.14 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  34.14 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  33.73 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  33.88 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.66 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  33.06 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  34.98 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  36.02 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  30.6 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  30.63 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  28.99 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  29.57 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.24 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  45.19 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>