More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1181 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  91.2 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  71.73 
 
 		 289 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  47.9 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  43.51 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 359 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  34.5 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 349 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  33.89 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  33.12 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  31.16 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.64 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.9 
 
 		 2762 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  30.32 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 255 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.21 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  29.29 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  29.41 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 322 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  27.11 
 
 		 257 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  30.51 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  28.95 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>