More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4458 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  47.94 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  43.53 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  45.55 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  45.04 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  44.28 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  46.15 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  39.04 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  40.23 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.41 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.71 
 
 		 408 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.34 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 257 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  28.74 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  27.46 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.02 
 
 		 2762 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  27.78 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.24 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  23.88 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  27.19 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  28.16 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2231  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  20.68 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>