More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4090 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
312 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
312 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
312 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  77.16 
 
 
294 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  76.95 
 
 
290 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  69.44 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 
292 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  45.91 
 
 
293 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 
280 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
303 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
303 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 
303 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 
303 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 
285 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 
291 aa  218  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
285 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
286 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 
299 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
299 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  40.62 
 
 
289 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  40.6 
 
 
301 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  43.79 
 
 
296 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  43.57 
 
 
290 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
294 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
305 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 
302 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  35.99 
 
 
303 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.47 
 
 
272 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.92 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  26.55 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 
607 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  27.24 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.21 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.8 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  29.73 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 
262 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  36.22 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.51 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.67 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.62 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  29.49 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.95 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
281 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.37 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>