More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10044 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  100 
 
 
298 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  67.69 
 
 
298 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  65.08 
 
 
298 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  64.16 
 
 
298 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 
298 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 
298 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  44.97 
 
 
326 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  32.95 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  30.59 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  23.71 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.61 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  23.14 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  27.85 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.27 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  23.99 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  29.06 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.24 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.3 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  22.67 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.91 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  23.92 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  23.11 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.69 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.24 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  25.49 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
258 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  22.37 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  28.5 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.1 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.1 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  27.41 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  29.21 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  27.5 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.86 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  24.22 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  20.58 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  27.17 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>