More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2250 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  44.95 
 
 		 293 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  45.74 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 		 295 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 		 294 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  41.1 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  41.81 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  42.25 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  43.27 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  29.24 
 
 		 408 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 		 626 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  25.38 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  24.51 
 
 		 607 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  27.87 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.61 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  23.66 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  24.01 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  27.34 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  27.55 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>