More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4921 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 322 aa  628  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.11 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.91 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.94 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.66 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  38.14 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.77 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.38 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  28.63 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5719  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.29 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0832  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  25.86 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  25.58 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  31.43 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  34.34 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  30.35 
 
 		 7149 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5340  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  30.95 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5429  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>