More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0608 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.86 
 
 
279 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
279 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.86 
 
 
279 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
279 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.86 
 
 
279 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
279 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
279 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28.28 
 
 
279 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  28.28 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.98 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
504 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
279 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
346 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.1 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  23.39 
 
 
315 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  23.39 
 
 
315 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.35 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.68 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  23.69 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  22.89 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.94 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.56 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  23.37 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.75 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.13 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.76 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.76 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.38 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  21.05 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  23.57 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.76 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
350 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  24.56 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.76 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  22.76 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  22.84 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  23.05 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  22.63 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.9 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  23.05 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>