More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2029 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 343 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  45.32 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  44.05 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  41.25 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  42.15 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  41.26 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  36.6 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  37.41 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.43 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  32.52 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 		 390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.05 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 371 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  34.06 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  34.06 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  34.06 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.7 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  33.7 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  33.81 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  33.81 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.75 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  39.06 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  25.44 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.03 
 
 		 271 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25 
 
 		 562 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>