More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2551 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 341 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  70.64 
 
 		 332 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  73.48 
 
 		 332 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  73.16 
 
 		 332 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  70.64 
 
 		 332 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  73.63 
 
 		 335 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  72.26 
 
 		 332 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  72.9 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 		 350 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  64.83 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  68.4 
 
 		 377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  64.1 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  66.34 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  64.1 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  62.42 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  62.89 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  61.82 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  64.42 
 
 		 353 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  62.86 
 
 		 877 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  62.97 
 
 		 353 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  62.03 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  62.66 
 
 		 387 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  61.77 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  62.86 
 
 		 404 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  62.86 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  62.78 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  62.97 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  62.86 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  62.66 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  62.66 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  62.86 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  62.86 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  64.05 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  59.42 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  56.11 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  55.66 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  49.69 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  51.15 
 
 		 331 aa  339  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  53.44 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  49.85 
 
 		 333 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  52.46 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  51.15 
 
 		 333 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  51.94 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  51.15 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  47.68 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  43.63 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  36.74 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.22 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  35.65 
 
 		 334 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  43 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.7 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.73 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  43.24 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.88 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.71 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  25.45 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.63 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.71 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.88 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  36.44 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>