More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6666 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  84.69 
 
 		 308 aa  510  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  45.12 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  38.7 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.17 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.67 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  41.74 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.47 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.98 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.66 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.71 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  28.69 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  29.1 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.68 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  35.71 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.35 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.38 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  34.38 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  34.4 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  35.34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.97 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  28.14 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.16 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>