79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0832 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0832  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
225 aa  428  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 
324 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
322 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
333 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
345 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
272 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
290 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
308 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  38.24 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  20.28 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
340 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
327 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  30.38 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
341 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 
338 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 
292 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.05 
 
 
277 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.96 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3138  hypothetical protein  29.41 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.766563  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 
289 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
278 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  27.95 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
275 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  31.03 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  21.79 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.51 
 
 
273 aa  45.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  31.97 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.71 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.05 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3991  alpha/beta hydrolase fold protein  23.2 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0793051  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.36 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  31.72 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
320 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
320 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  32.26 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  27.16 
 
 
326 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
310 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  21.81 
 
 
571 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
387 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.89 
 
 
456 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
279 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
315 aa  42  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
243 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.79 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.66 
 
 
278 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
366 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
363 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
317 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>