More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0938 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
320 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  97.81 
 
 
320 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  89.87 
 
 
302 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  89.87 
 
 
302 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  89.87 
 
 
302 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  91.32 
 
 
306 aa  520  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  82.68 
 
 
302 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  83.57 
 
 
318 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  79 
 
 
303 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  78.67 
 
 
303 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  78.67 
 
 
303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  78.33 
 
 
303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  78.67 
 
 
303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  81.36 
 
 
280 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  81.36 
 
 
280 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  73.36 
 
 
301 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  67.01 
 
 
315 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  72.79 
 
 
303 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 
277 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  43.8 
 
 
288 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  40.07 
 
 
288 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  40.62 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  40.62 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  40.62 
 
 
279 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  40.78 
 
 
279 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  33.09 
 
 
280 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
276 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  38.19 
 
 
277 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.77 
 
 
279 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
286 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  37.99 
 
 
289 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  41.48 
 
 
289 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
289 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
284 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.81 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  42.18 
 
 
559 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  34.66 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  38.73 
 
 
286 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  33.73 
 
 
277 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  33.33 
 
 
277 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 
290 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
290 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
281 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
302 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
253 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
278 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
278 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 
257 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
257 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
268 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  39.07 
 
 
279 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
275 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
294 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  34.98 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  35.16 
 
 
274 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  35.06 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.73 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.76 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
250 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
328 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  30.59 
 
 
253 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  27.73 
 
 
267 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
267 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  27.73 
 
 
267 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
263 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  27.73 
 
 
267 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
245 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  27.73 
 
 
272 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  27.73 
 
 
267 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  27.73 
 
 
267 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  27.34 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  27.73 
 
 
277 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  27.34 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  27.34 
 
 
267 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
306 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
254 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  30.37 
 
 
585 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34489  predicted protein  28.41 
 
 
280 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31753  predicted protein  26.9 
 
 
382 aa  87  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0547  alpha/beta hydrolase fold protein  35.63 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
594 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  28.62 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  25.81 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>