More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1778 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
366 aa  707    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  44.28 
 
 
303 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  42.8 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.85 
 
 
343 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 
352 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
322 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 
344 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  37.32 
 
 
363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.43 
 
 
275 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
273 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.58 
 
 
265 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.8 
 
 
262 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.72 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
286 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.83 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.83 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.24 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.6 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
278 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.94 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.57 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.6 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.72 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
324 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
273 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
270 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.49 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.83 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  27.37 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.91 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.9 
 
 
265 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.12 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.86 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.23 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  31.36 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
270 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
284 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.56 
 
 
562 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.67 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>