More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2519 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  78.75 
 
 
243 aa  380  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.36 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.73 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.81 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.34 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  33.5 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.95 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.99 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  41.74 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.25 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  28.41 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.89 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  26.15 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
324 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
270 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  36.19 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
270 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  45.13 
 
 
260 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
334 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  27.12 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  28.44 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  28.49 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.22 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.01 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  32.58 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.91 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.24 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.43 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>