More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5471 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  40.62 
 
 
387 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  40.24 
 
 
387 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  40.62 
 
 
387 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
387 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  37.2 
 
 
475 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
265 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
264 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
273 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.81 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.12 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
279 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.88 
 
 
275 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  32.07 
 
 
275 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  28.8 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.08 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  28.34 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  28.8 
 
 
269 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  28.8 
 
 
269 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  28.34 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  28.34 
 
 
269 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  27.6 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.72 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  27.87 
 
 
269 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
284 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
269 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
273 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
229 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.13 
 
 
372 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.6 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.54 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.36 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  24.61 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.6 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.6 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.79 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.02 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.79 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.44 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.45 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.16 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.82 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.2 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.07 
 
 
562 aa  80.1  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>