More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0445 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  89.15 
 
 
258 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  88.37 
 
 
258 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  73.15 
 
 
254 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  68.87 
 
 
254 aa  363  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  67.7 
 
 
254 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  57.59 
 
 
255 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  56.42 
 
 
250 aa  294  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  53.7 
 
 
255 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  51.56 
 
 
249 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  50.58 
 
 
250 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  50.58 
 
 
250 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  50.58 
 
 
250 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  50.19 
 
 
257 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  55.16 
 
 
261 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  50.97 
 
 
256 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  52.33 
 
 
251 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  50.58 
 
 
256 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  49.42 
 
 
250 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  52.14 
 
 
251 aa  248  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  52.16 
 
 
261 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  51.37 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  53.97 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  50.19 
 
 
250 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  50.2 
 
 
256 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 
248 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 
250 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  37.18 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
272 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
268 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
262 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  32.33 
 
 
251 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  29.8 
 
 
275 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  30.29 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
340 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.91 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  28.76 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.1 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.92 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.93 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  43.56 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  28.26 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.52 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.6 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  27.83 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  35.43 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.08 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.99 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
267 aa  72  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.15 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  27.91 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  35.17 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  37.61 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  27.24 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  37.61 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  38.33 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  37.61 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  37.61 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>