103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1649 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  30.91 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  31.44 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  30.45 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  32.59 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.19 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  28.95 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  28.95 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  32.47 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  31.35 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  28.4 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  32.73 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.64 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  28.32 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0781  abhydrolase  42.31 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  30.89 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.74 
 
 		 462 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.86 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  29.08 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 312 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.75 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.69 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 289 aa  45.1  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  26.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  29.83 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.05 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.04 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  39.8 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  41.67 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  24.23 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.48 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  35.85 
 
 		 456 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 278 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>