More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6150 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  54.61 
 
 
293 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  50.87 
 
 
291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  48.2 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  48.85 
 
 
300 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  48.2 
 
 
296 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 
295 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
290 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.22 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.22 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.22 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.22 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.22 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.22 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.45 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.55 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.13 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.1 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.24 
 
 
571 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.29 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.07 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
350 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
278 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  30.5 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  39.42 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
370 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.6 
 
 
370 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.32 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
425 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.88 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
381 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
330 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.12 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  29.72 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.3 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
292 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
343 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.82 
 
 
370 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>