More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1611 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  98.99 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  72.56 
 
 		 300 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  57.75 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  56.49 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  56.51 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  49.63 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.24 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.27 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.64 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.78 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.4 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  34.86 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.3 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.2 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.62 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.37 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.98 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.03 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  38.89 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.34 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.17 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.68 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  25.76 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>