More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0504 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  100 
 
 		 571 aa  1142    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 562 aa  428  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 317 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 381 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 307 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 360 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.38 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 297 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 319 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 300 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 358 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 335 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 321 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  38.11 
 
 		 663 aa  157  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 321 aa  157  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 326 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 352 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.48 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 297 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 327 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 332 aa  150  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  34.98 
 
 		 321 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  35.92 
 
 		 646 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  33.79 
 
 		 614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 352 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 324 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 298 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 325 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 327 aa  147  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 354 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  33.7 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 346 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.67 
 
 		 351 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.87 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 324 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 328 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  35.02 
 
 		 648 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 358 aa  143  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 357 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  35.32 
 
 		 647 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  34.51 
 
 		 590 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 331 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 350 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 352 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 320 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.12 
 
 		 593 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 357 aa  140  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.98 
 
 		 606 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 349 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  32.59 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  33.83 
 
 		 643 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 350 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.93 
 
 		 589 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  33.12 
 
 		 593 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.27 
 
 		 350 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 339 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  33 
 
 		 349 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.97 
 
 		 830 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 293 aa  137  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 370 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 310 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 357 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 320 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 357 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 341 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 357 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 356 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 356 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 354 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 340 aa  133  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>