More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3391 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 336 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  77 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  60.46 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  60.46 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  60.33 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  42.21 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  39.17 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  39.45 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  38.12 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  39.14 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  39.48 
 
 		 344 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 387 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  42.67 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  39.16 
 
 		 355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  40.79 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 		 353 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  39.32 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  38.83 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  36.89 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 		 877 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 263 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.29 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 265 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 264 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 271 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 314 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.56 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.25 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.63 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.04 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.39 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.24 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.39 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.54 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>