More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5020 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 334 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  75.08 
 
 		 336 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  60.69 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  60.26 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  60.26 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.29 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  37.57 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  39.41 
 
 		 333 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  42.63 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  37.95 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  39.61 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  38.74 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  38.53 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  39.94 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  40.58 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  39.94 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  40.63 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  37.57 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 353 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 353 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  38.54 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  39.79 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  37.46 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  41.37 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  40.65 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  40.59 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  40.59 
 
 		 439 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  40.59 
 
 		 441 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  40.59 
 
 		 877 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  40.59 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.64 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  45.92 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  43 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  36.55 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  33.93 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.2 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.78 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>