More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  49.01 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  40.32 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  40.32 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  40.6 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  41.02 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  38.2 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.62 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  41.04 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 272 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  35.22 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  32.39 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  33.86 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  38.02 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.82 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  28.51 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  30.74 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.81 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.25 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.83 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.52 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  27.66 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  30.74 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  41.11 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  37.61 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.83 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  38.61 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  35.34 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>